Najstarejša slovenska znanstvena ustanova vas popelje od 60 000 let stare neandertalske piščali in mamutovega okostja do mineralov barona Zoisa, jamske človeške ribice in sodobnih dioram slovenskih ekosistemov. V neorenesančni palači na Muzejski ulici so zbrane geološke, paleontološke, zoološke in botanične zbirke, ki razkrivajo naravno dediščino in razvoj sveta okoli nas.